Část materiálu byla na základě těchto výhrad upravena, v mnoha případech ale nebyly připomínky uspokojivě vyřízeny nebo na ně ministerstva nereagovala. Ministerstvo dopravy se dokonce vyjádřilo posměšně o zákonu o liniových stavbách a popřelo tím Programové prohlášení vlády.

Piráti si sice cení věcné reakce resortu školství a zemědělství i Úřadu vlády ČR a jejich podrobného zdůvodnění návrhů i Ministervo financí některé připomínky akceptovalo jako relevantní, většina ministerstev, např. Ministerstvo pro místní rozvoj, Ministerstvo vnitra nebo Ministerstvo práce a sociálních věcí se ale k připomínkám Pirátů nevyjádřila vůbec.

Svým přístupem Piráty zaskočilo Ministerstvo dopravy ČR. K připomínce, že v materiálu není vůbec řeč o zákonu o liniových stavbách, ministerstvo uvedlo: „Postačuje v současnosti předložený zákon o urychlení výstavby dopravní infrastruktury, který v reálu zákonem o liniových stavbách je. Není zřejmé, jaké jiné konkrétní problémy, by měl „mýtický a všespásný“ zákon o liniových stavbách řešit?“ Postoj MD je tak v rozporu s Programovým prohlášením vlády, které jasně hovoří o zákonech o liniových stavbách a o urychlení výstavby dopravní infrastruktury jako o dvou samostatných normách. Především se však potvrzuje to, čeho se Piráti obávali: Vláda hodlá zalepit problém několika vybraných staveb rychle schváleným a špatně napsaným zákonem o urychlení výstavby a ambici prosadit skutečný všeobecný zákon o liniových stavbách ani nemá.