Spolu se členy správní rady premiér Bohuslav Sobotka diskutoval o jednotlivých projektech, které jsou financovány z prostředků Fondu. Od roku 1998 poskytl Fond zhruba 54 mil. eur na 9 500 projektů, které přivádí dohromady Čechy a Němce. Především jde o projekty zaměřené na mládež a školy, kulturu, vědu, obnovu památek, sociální podporu a další. Fond zabezpečuje také činnost Česko-německého diskuzního fóra.

Vláda Bohuslava Sobotky v květnu 2016 rozhodla, že na činnost fondu bude v letech 2018 - 2027 postupně uvolněno celkem 270 milionů korun. Ve stejném období vyčlení také německá vláda 25 milionů eur.