COVID-19 významně zasáhl i do aktivit výcvikové mise v Mali, které teď velí Češi. V dubnu musela polovina personálu mise odcestovat domů a aktivity se výrazně utlumily. Omezily se pouze na poskytování poradenství malijským ozbrojeným silám na strategické úrovni, zabezpečení logistické podpory a ochrany velitelství a výcvikového kempu. Výcvik malijských vojáků se musel zredukovat na nezbytné minimum. I přes velmi omezené možnosti se podařilo pokračovat ve výcviku instruktorů malijské armády.

Nemoc na jaře také postihla některé evropské vojáky, velitelství mise se na velmi krátký čas doslova uzamklo. Nicméně okamžitou reakcí ze strany velení se podařilo epidemii dostat pod kontrolu, nemocné včas evakuovat do domovských zemí a zajistit omezený režim fungování celé mise.

Češi přesvědčili ústředí, že se výcvik musí obnovit

V polovině června, kdy Češi, už za přísných hygienických opatření, přebírali velení, již věděli, že jeden z jejich hlavních úkolů bude navrácení výcvikových aktivit do původního stavu a vytvoření podmínek pro implementaci nového, pátého, mandátu, který rozšiřuje prostor operace do celého Mali, navyšuje personál i rozpočet.