V podvědomí široké veřejnosti se však moc neví, že léčba dětských pacientů se solidními nádory a leukémiemi je doprovázena nejen četnými časnými, ale zejména i pozdními komplikacemi, které mohou významně ovlivňovat následnou kvalitu jejich života. Riziko je tím vyšší, čím mladší je léčené dítě. Poškozena může být většina tkání, orgánů a systémů vyvíjejícího se organismu, a to i po mnoha letech. Vznik pozdních následků ovlivňuje nejen rozsah a druh nádoru či způsob léčby, ale také reaktivita každého jedince. Dlouhodobé analýzy dokládají jejich vznik až u 66 % vyléčených dětí. Některé z těchto pozdních léčebných komplikací mohou tyto děti ohrožovat v budoucnosti i na životě.

Specializované centrum těchto pozdních následků KDHO založil profesor Josef Koutecký již v roce 1998. V tomto centru se aktuálně sleduje více než 3 458 dlouhodobě vyléčených pacientů od dětství až do dospělosti (z celkového počtu 6 423 léčených dětských pacientů v rozmezí let 1979-2010).