Úředníci z udělené výjimky odstranili největší zjevné nezákonnosti - například příliš vysoký denní limit pro oxidy dusíku. Přidali také povinnost přezkoumat výjimku po 3 letech. Nevypořádali se ale s největšími problémy výjimky - příliš vysokým emisním limitem pro rtuť i s příliš dlouhou dobou platnosti výjimky.

Délka výjimky pro elektrárnu patřící do portfolia uhlobaronů Pavla Tykače a Jana Dienstla, je navíc nezvykle dlouhá i v porovnání s jejich konkurencí. Například firma ČEZ o výjimky pro oxidy dusíku nežádá téměř vůbec a pro rtuť žádá u svých elektráren většinou jen odklad o dva až čtyři roky. (2) Neplatí tak argumentace provozovatelů elektrárny Chvaletice, že se nedá v tak rychlé době na limity pro rtuť připravit.