Cizinci nebudou za „neoprávněný“ pobyt nijak sankcionováni, protože de facto uvízli na území České republiky bez vlastního přičinění. Jejich pobyt však nelze dále legalizovat opatřením Ministerstva zdravotnictví. Ministerstvo vnitra proto přijalo opatření, díky kterému cizinci po ukončení nouzového stavu získají 60 dní na vyřízení povinnosti opustit republiku podle zákona o pobytu cizinců.

Policie v těchto případech nebude zahajovat správní vyhoštění ani řízení o povinnosti opustit území.