Rekonstrukce hlavní budovy byla realizována ve třech etapách. Projektové práce byly zahájeny v roce 2002, dokončena byla v září roku 2012. Z celkových nákladů ve výši 410 milionů korun bylo čerpáno 131 milionů korun z rozpočtu Ministerstva kultury v rámci Programu péče o národní kulturní poklad.

Chronologická rekapitulace rekonstrukce hlavní budovy:

- 2002 – zahájení projektových prací
- 2003 až 2004 I.etapa rekonstrukce – 58 mil.Kč
- 2005 až 2008 II.etapa rekonstrukce – 221 mil.Kč
- 2010 až 2012 III.etapa rekonstrukce – 131 mil.Kč