Od prvního ledna 2017 vznikne Sekce finanční kriminality. O jejím zřízení (hovorově nazývané termíny Finanční policie, či FIPO) se hovořilo již v době vniku „centrály“. Sekce finanční kriminality bude výrazně personálně posílena a její součástí bude nově i pracoviště zaměřené na aktivní odhalování finanční kriminality. Nová sekce bude rovněž zastřešovat i velice úspěšný projekt Daňové Kobry. Vedení NCOZ si od vzniku této sekce slibuje efektivnější práci v rámci boje proti daňové kriminalitě, praní peněz a zajišťování výnosů z trestné činnosti.

Další změnou je personální posílení některých významných problematik útvaru. Jde o závažnou hospodářskou trestnou činnost a kybernetickou kriminalitu.