Dne 7.1.2021 policejní orgán Úřadu dokumentace a vyšetřování zločinů komunismu služby kriminální policie a vyšetřování zahájil trestní stíhání PhDr. Jana Fojtíka, CSc., pro zvlášť závažný zločin zneužití pravomoci úřední osoby podle § 329 odst. 1 písm. c), odst. 2 písm. b), e) tr. zákoníku ve znění účinném do dne 30.11.2011.

PhDr. Jan Fojtík, CSc., jako člen předsednictva Ústředního výboru Komunistické strany Československa si byl vědom toho, že na státních hranicích tehdejší Československé socialistické republiky dochází k používání střelných zbraní ze strany příslušníků Pohraniční stráže proti osobám, které se státní hranice snaží neoprávněně překročit za účelem opustit tehdejší Československou socialistickou republiku. I přes to ze své pozice vedoucího představitele Československé socialistické republiky nepřijal žádné opatření, kterým by používání střelných zbraní zabránil. Federální ministr vnitra měl při tom ve své kompetenci nařízeními a rozkazy upravovat práva a povinnosti příslušníků Pohraniční stráže, včetně oprávnění užít zbraň, a předsednictvo Ústředního výboru Komunistické strany Československa, jehož byl PhDr. Jan Fojtík, CSc. členem, mělo prokazatelný přímý vliv na členy Vlády Československé socialistické republiky a mohlo jim ukládat pokyny, jaké právní předpisy upravit či přijmout, což i v oblasti ochrany státních hranic opakovaně činilo, nikoli však ve směru k zabránění použití střelných zbraní.