Certifikace znamená, že platby za již uskutečněné projekty daného programu souhrnně odesílá ministerstvo financí Evropské komisi. Komise po kontrole výdajů za projekty posílá do ČR peníze z evropských fondů. Proces certifikace na proplácení prostředků za projekty v ČR ale nemá vliv, neboť proplácení projektů probíhá díky zálohovým platbám ze státního rozpočtu jednotlivým programům, respektive řídícím orgánům, v tomto případě Regionální radě Jihozápad.

„Proces certifikace trval na straně Evropské komise jen jeden měsíc, což je vzhledem k obvyklým lhůtám velmi rychlé. Svědčí to o formální správnosti projektů, kontrol a vlastně celého procesu udělování dotací prostřednictvím ROP JZ. Za to patří velký dík zaměstnancům Úřadu Regionální rady regionu soudržnosti Jihozápad,“ uvedl Ivo Grüner, předseda Regionální rady ROP Jihozápad a zástupce hejtmana Plzeňského kraje.