NKÚ se při své kontrole zaměřil na tři oblasti – smlouvy na technické střežení muničních skladů, závodní stravování a úklid a chod ubytoven.

Smlouvy na technické střežení muničních skladů byly v roce 2014 předmětem auditu zadaného novým vedením resortu, který posuzoval všechny obchodní smlouvy v objemu nad 100 milionů Kč. Současná smlouva na střežení muničních skladů už vychází z výběrového řízení, ve kterém nejvýhodnější nabídku podala společnost Trade Fides. Oproti předpokladu byla cena pětileté zakázky dokonce o 78,5 milionů Kč nižší.

NKÚ kontroloval také smlouvy na zajištění stravy a uvádí, že Ministerstvo obrany nevýhodně nastavilo ceny za odebrané porce. Při poklesu strávníků se cena za jednu porci výrazně zvyšuje. Tato skutečnost je dána pevnými režijními náklady na straně poskytovatelů služby. Snížení počtu strávníků se tak projeví na nárůstu ceny za jednu porci.