Mezi ně patří především ochrana území ČR před zavlečením nákaz, které by mohly znamenat riziko pro člověka (zoonóz), nebo pro zdraví zvířat a v případě výskytu těchto nákaz přijetí opatření k zamezení jejich šíření. Podrobné informace jsou dostupné v dokumentu Zpráva o činnosti v oblasti zdraví zvířat za rok 2020, který SVS aktuálně zveřejnila na svém webu.

Po dvou letech bez výskytu ptačí chřipky v ČR byla v roce 2020 potvrzena dvě ohniska vysoce patogenní ptačí chřipky (HPAI). První ohnisko bylo potvrzeno v Kraji Vysočina (malochov drůbeže) a druhé v Pardubickém kraji (velkochov krůt a brojlerů). Po úspěšné likvidaci obou ohnisek získala ČR od 12. 6. 2020 zpět status země prosté ptačí chřipky. V roce 2020 nebyl na území ČR potvrzen výskyt Newcastleské choroby drůbeže, ale byly zjištěny dva případy paramyxovirózy holubů, jehož původce je blízce příbuzný původci Newcastleské choroby.

V loňském roce se v ČR nevyskytl africký mor prasat (AMP) a to ani v chovech prasat domácích, ani v populaci volně žijících prasat divokých. I nadále tak platí, že poslední tuzemský případ této nákazy byl zaznamenán 15. 4. 2018 u uhynulého prasete divokého. Přes tento pozitivní vývoj pokračoval i v roce 2020 monitoring AMP na celém území ČR. V rámci pasivního monitoringu byla vyšetřována všechna nalezená uhynulá prasata divoká včetně prasat sražených dopravním prostředkem a pokračovalo i vyšetřování domácích prasat v indikovaných případech (prasnice po zmetání, hromadné úhyny, podezření). Všechna vyšetření provedená v průběhu celého roku 2020 byla negativní.