Nejsilnější spojenectví na politické scéně. I to je podle odborníků vztah mezi Andrejem Babišem a prezidentem Milošem Zemanem. Ještě v roce 2011 přitom označil Miloš Zeman tehdy politického nováčka Andreje Babiše za nevěrohodného a připomněl Babišovu nepovedenou privatizaci Unipetrolu, o 2 roky později Babiš prohlásil, že pro první přímou prezidentskou volbu je Miloš Zeman tím nejhorším možným kandidátem a podpořil Karla Schwarzenberga. S vládním angažmá Andreje Babiše se ale vztah Babiš–Zeman začal měnit, při neshodách s premiérem Bohuslavem Sobotkou Miloš Zeman tehdejšího ministra financí dlouho podporoval, po parlamentních volbách v roce 2017 pak dvakrát pověřil Andreje Babiše sestavením vlády, a to bez jakékoliv záruky o předjednané podpoře kabinetu. Andrej Babiš zase před druhou prezidentskou volbou veřejně podpořil Miloše Zemana.