Probíhající audit Ministerstva financí, prověřující čerpání peněz z EU u dvou desítek českých nemocnic, způsobil názorový rozkol uvnitř vládní koalice. Ministr zdravotnictví Svatopluk Němeček (ČSSD) zpochybňuje transparentnost auditu, šéf státní kasy Andrej Babiš odkazuje na Evropskou komisi a obviňuje sociální demokracii z předvolebního boje. Do mediální přestřelky byl nakonec nucen vstoupit premiér Sobotka, který si po skončení auditu hodlá oba ministry pozvat a celou věc urovnat.

Tomáš Cikrt v pořadu České televize vyjádřil přesvědčení, že tak velký problém, za jaký je celá věc vydávána, to není. Nicméně má obavy, zda se zdravotnictví nestává kolbištěm politického boje. Podle něj nejde ani tak o předvolební boj jako o celkovou moc ve státě a kontrolu nad penězi ve zdravotnictví. Dojem boje o moc v něm způsobuje zejména to, že pochybení bylo nalezeno u všech prověřovaných nemocnic, a také probíhající mediální invaze Ministerstva financí.