Nejvyšší představitel sudetských Němců Bernd Posselt Seehofera označil za průkopníka bavorsko-českého a sudetoněmecko-českého sblížení. Je prý garantem, že dialog s pražskou vládou bude pokračovat. Velkým krokem vpřed v tomto sbližování Posselt nazval únorovou návštěvu českého premiéra Petra Nečase v Bavorsku, při níž Nečas zopakoval lítost Česka nad křivdami, které způsobilo poválečné vysídlení sudetských Němců z tehdejšího Československa.

Seehofer v roce 2010 jako první bavorský premiér po pádu železné opony zavítal do Prahy na oficiální návštěvu, čímž prolomil politické ledy ve vztazích mezi českou a bavorskou vládou. Ty v předchozích desetiletích zatěžoval především rozdílný pohled na vysídlení německé menšiny z Československa po druhé světové válce. Většina sudetských Němců tehdy zamířila právě do Bavorska, kde o té doby tvoří takzvaný čtvrtý kmen.