Mezi omezení některých spojů patří hlavně vlak SC Pendolino. V červenci a srpnu, kdy je z důvodu dovolených a prázdnin každoročně o něco nižší zájem, pojedou brzké ranní spoje jen v pondělí. Změn v periodě jízdy je však větší množství. Dráhy téměř zrušily spoj, který jede z Prahy po jedenácté dopoledne. Některé spoje budou omezeny i o víkendech.

Naopak rozšíření nabídky spojů plánují České dráhy mezi Prahou a Brnem v souvislosti s opravou dálnice D1. ČD si zarezervovaly trasy pro dva dopolední vlaky, které ponesou název D1 Express. Ty nemají mezi Prahou a Brnem vůbec nikde zastavovat