V letech 1993-1999 byl děkanem Právnické fakulty v Plzni. Byl jejím prvním děkanem, v roce 1999 předal její vedení Milanu Kindlovi, se kterým poté byly spojeny největší skandály se studiem.

Jak upozornila Jana Bobošíková ve svém pořadu Aby bylo jasno, jako děkan přijal ke studiu Jana Rumla, bývalého ministra vnitra. Tomu k úspěšnému složení zkoušek přitom chybělo třináct bodů. Komentoval to tak, že „je běžné, že vysoké školy takto přijmou významnou osobnost, třeba známého sportovce, protože jim to zvyšuje kredit“. Na Západě by prý za zisk takto prestižního studenta dostal poděkování.

Jan Ruml studoval v době, kdy byl současně místopředsedou Senátu, ale tvrdí, že žádný protekční student nebyl, spíše to měl proti kolegům náročnější.