V únoru 2013 Jana Nagyová slíbila Ondreji Páleníkovi, nedávno sesazenému z postu šéfa Vojenského zpravodajství, že z něj bude prezident Nejvyššího kontrolního úřadu - tedy jedna z nejvýznamnějších funkcí v zemi. Jeho zvolení měl zařídit premiér Petr Nečas, který ovšem narazil na odpor spolustraníků.

„Myslela jsem, že už jsi opustil tu maloměstskou pózu pantáty, ale zřejmě mi chceš dokazovat, kým jsi. To nemusíš, já ti pomáhala se tam dostat a udržet,“ napsala vzápětí rozčílená Nagyová svému šéfovi v SMS. „Tohle chování není poprvé. Vezmu si volno, musíme si rozmyslet, co a jak,“ dodala. Následovalo několik vzrušených telefonátů, ve kterých předseda vlády své tajemnici zahanbeně vysvětloval okolnosti a omlouval se.

Podle policejního dokumentu, který byl v minulém týdnu rozeslán obviněným, se měly ve vztahu obou běžně mísit osobní záležitosti s pracovními. Zejména ze strany Jany Nagyové, která prý ráda vytahovala společný život obou jako argument při řešení politických otázek.