V roce 2002 Halíka ke kandidatuře na prezidenta vyzval Václav Havel, se stejným návrhem za ním tehdy přišlo i několik politických stran. Halík vysvětluje, že to nakonec nedopadlo, protože mnoho lidí vůči němu chová nenávist. „Já jsem si uvědomil, že pro značnou část společnosti reprezentuju přesně to, co oni nenávidí. Je část společnosti, a ne malá, která nenávidí Pražáky, nenávidí kněze, nenávidí bývalé disidenty, nenávidí přátele Václava Havla, nenávidí intelektuály.

 Já jsem toto všechno v jednom. Nenajdete člověka, který by v sobě ztělesňoval všecko, co tihle lidé nenávidí. Není to většina lidí, ale je to velmi halasná část, který by se spustila strašlivé věci v předvolební kampani,“  říká Tomáš Halík v rozhovoru pro Seznam Zprávy s tím, že naráží na odpor i u velké části české katolické církve.