Hlavním důvodem je podle deníku, který vlastní právě ministr financí Babišovo přesvědčení, že zdravotnictví je černou dírou na peníze, kde utíkají peníze soukromým skupinám. S touto utkvělou představou prý šéf ANO přišel do politiky a zvláštní pifku má na ty, kteří v nemocnicích působili od roku 2006, kdy podle něj došlo po nástupu ODS k řádovému nárůstu korupce. Němeček má tu smůlu, že do čela ostravské nemocnice přišel právě v roce 2006, takže na něj Babiš kouká automaticky nedůvěřivě.

Nejvážnější třecí plochou mezi oběma ministry jsou předražené nákupy zdravotnické techniky. Babiš je přesvědčen, že ji Němeček nakupoval zbytečně draho a z přebytku posílal peníze spřáteleným strukturám. Dovolává se především stanoviska Evropské komise a také auditu, který prováděl jeho náměstek Lukáš Wagenknecht. Nejčatěji Němečkově nemocnici vytýkají předražený nákup přístrojů pro onkologické centrum a rovněž onkologický kybernůž. Němeček se však brání, že u takto unikátních technologií se prakticky vždy šije objednávka „na míru“ podle specifikace a doprovodných služeb, takže i ceny se značně liší. „Tento přístroj kupovaly nemocnice v USA kolem čtyř milionů dolarů, Němečkova fakultka ho koupila za deset milionů,“ trvá na svém Babiš.