Jedním z témat bylo plánované vybudování lanovky přímo v chráněné šumavské oblasti. Přímo pro ni byl vyčleněn několik metrů široký pás území, které jinak patří k chráněné části parku. Tato část půdy ale byla z návrhu zákona o Národním parku Šumava vyňata. Vyvstávaly tak obavy, aby se nezačal tento “pruh” rozšiřovat na úkor okolní přírody. “Jestli chceme přidat jen jeden metr, musíme získat souhlas obcí. Pro mě je nepřijatelné, aby to znamenalo vybudování nového lyžařského areálu,” svěřil se Chalupa.

Kritika se také snesla na plánovanou velikost bezzásahových zón parku, která by měla být 35 %, což je skoro nejmenší číslo v celé Evropě. Sousední rakouský národní park má oproti tomu těchto zón přes 75 %. "Samozřejmě, že jednoduché řešení by bylo, kdybychom vyňali z parku obce, které jsou jeho součástí. Ale já to nedělám pro to, aby to bylo hezké procento, ale pro to, aby to byl funkční systém. Jsem zastáncem toho, že obce do parku patří. Můj cíl je vytvořit funkční mechanismus,” vysvětluje Chalupa.