V případu Fujitsu Technology vyčítá obžaloba Šiškovi to, že zakázku zadal bez výběrového řízení namísto toho, aby dodavatele systému nechal vybrat v otevřené soutěži. Prý k tomu v roce 2011 s vědomím Dudy účelově využil rámcovou smlouvu, kterou mělo s Fujitsu Technology od roku 2008 uzavřenou vnitro.

Státní zástupce Zdeněk Matula dnes v závěrečné řeči u pražského městského soudu navrhl potrestat oba muže za zneužití pravomoci, sjednání výhody a porušení povinnosti při správě cizího majetku. Šiška si podle něj zaslouží šestileté odnětí svobody a měl by také nahradit škodu ve výši uvedené v obžalobě, tedy 282 milionů korun. Ministerstvo práce chce, aby mu oba obžalovaní společně zaplatili výrazně více - 529 milionů korun. Podle Matuly by měl soud odkázat úřad se zbytkem nároku na občanskoprávní řízení.