Případ soudce Jiřího Berky nepovažuje Ministerstvo spravedlnosti ČR stále za uzavřený. Do kauzy vstoupil státní zástupce a podal stížnost. Ministerstvo samo hodlá využít všechny své kompetence k tomu, aby návrat soudce Jiřího Berky do taláru nebyl jednoduchý. Platí, že ministerstvo tento důsledek amnestie prezidenta republiky nevítá. Budou-li zachovány účinky trestních stíhání, které nepodléhají amnestii, pak ministr spravedlnosti neprodleně a opětovně zprostí soudce Jiřího Berku výkonu funkce soudce.