V pátek 6. června 2014 rezignoval předseda Pirátů Ivan Bartoš a čtyři místopředsedové a místopředsedkyně. Ivan Bartoš, 1. místopředsedkyně Lenka Wagnerová a 2. místopředseda Michal Havránek rezignovali s okamžitou platností. 3. místopředsedkyně Jana Michailidu a 4. místopředseda Tomáš Vymazal podali rezignaci k datu konání zasedání nejvyššího orgánu strany, celostátního fóra. V těchto dnech současně probíhají volby pěti vedoucích odborů, kteří ve straně zodpovídají za technické, administrativní, finanční, mediální a jiné záležitosti. Jejich mandáty skončily z různých důvodů v posledním měsíci. Strana se tak ocitla prakticky bez vedení.

Pirátská strana však bude až do konání svého nejvyššího orgánu Celostátního fóra (CF) v průběhu letních prázdnin plně fungovat dál. Iniciativu nyní přebírají místní a krajská sdružení. Ta se kromě běžného pořádání hudebních a kulturních festivalů a besední a osvětové činnosti nyní i připravují na komunální i senátní volby, kde Piráti postaví vlastní i koaliční kandidáty.