Zástupce ombudsmanky vedl šetření z vlastní iniciativy vůči Ministerstvu zdravotnictví. Z více podnětů zjistil, že pokud ve stavebních řízeních účastníci nesouhlasili se závazným stanoviskem krajské hygienické stanice a odvolali se proti němu, stavební řízení se tím na měsíce i roky zastavilo. Krajský úřad, k němuž se odvolali, totiž musel dát podnět Ministerstvu zdravotnictví, aby závazné stanovisko krajské hygienické stanice přezkoumalo. Dokud se ministerstvo nevyjádří, nemůže krajský úřad ve vyřizování odvolání pokračovat. Zástupce ombudsmanky z konkrétních případů i z informací od krajských úřadů zjistil, že ministerstvu trvá přezkoumání závazného stanoviska KHS měsíce i roky. Průtahy ministerstva významně komplikovaly situaci stěžovatelů i krajských úřadů. Stěžovatelé nemohli pokračovat v realizaci svých stavebních plánů a vinu dávali krajskému úřadu, který o jejich odvolání nerozhodl. Krajské úřady zase bezvýsledně urgovaly ministerstvo, protože bez jeho přezkumu závazného stanoviska nemohly o odvolání rozhodnout.

V rámci šetření se zástupce ombudsmanky sešel s ministrem zdravotnictví k diskuzi nad odstranění průtahů a jejich příčin. Ministr spatřoval příčinu zejména v nedostatečném personálním zajištění při současné složitosti dané problematiky a také ve vysokém počtu mnohdy účelových podání, jejichž vyřizování negativně ovlivňuje lhůty pro vyřízení ostatních.