Spolupráce v oblasti bezpečnosti a obrany je jedním z pilířů česko-švédských vztahů. Mezi rezorty obrany probíhá intenzivní politický dialog a rozvíjí se také praktická spolupráce v řadě oblastí, např. v ochraně proti zbraním hromadného ničení, vyzbrojování či výcviku. Dosud nejzřetelnějším a nejúspěšnějším programem česko-švédské obranné spolupráce je pronájem švédských stíhacích letounů Jas 39 Gripen. Potenciál pro další prohlubování obranné a bezpečnostní spolupráce představuje především oblast obranného průmyslu, v níž si mají oba státy vzájemně co nabídnout. K identifikaci možností praktické spolupráce mezi českými a švédskými firmami významně přispěly Česko-švédské dny obranného průmyslu, které se uskutečnily 12. října 2016 ve Stockholmu.

V rámci dopoledního programu se premiér Bohuslav Sobotka setkal na stockholmské radnici s nejvýše postavenou představitelkou města, předsedkyní městské rady Evou-Louise Erlandsson Slorach. Společně hovořili o tématech, kterými se v současné době zabývá Stockholm i česká města, a to je dostupné bydlení, rozvoj veřejné dopravy, koncept Smart Cities či spolupráce v rámci sítě evropských měst a regionů.

V odpoledních hodinách navštívil premiér Sobotka Karolinska Institutet, který úzce spolupracuje s českým Centrem CEITEC VUT v Brně. Přední švédská lékařská univerzita ve Stockholmu se zaměřuje výhradně na zdravotní péči a nabízí nejširší škálu lékařského vzdělání ve Švédsku, zároveň se řadí mezi 50 nejlepších univerzit z celého světa a 10 nejprestižnějších lékařských univerzit v Evropě. V rámci své návštěvy si premiér Bohuslav Sobotka prohlédl mimo jiné rentgenovou a mikro a nanotomografickou laboratoř.