V roce 2005 proběhl asi dodnes nejznámější CzechTek. Nejznámější se tato hudební akce však nestala kvůli tomu, co se na akci hrálo, ani kvůli tomu, že by se akce zúčastnilo obrovské množství lidí, bylo jich tehdy jen 5 tisíc, což bylo méně než obvykle, ale kvůli policejnímu zásahu, který nařídil tehdejší policejní prezident Ladislav Husák. Asi tisíc těžkooděnců s pomocí vodních děl akci rozehnalo. CzechTek se konal na pozemku majitele, který s akcí souhlasil, ale strážci zákona tehdy CzechTek rozehnali s tím, že musí ochránit práva majitelů okolních pozemků. Tehdejší předseda vlády Paroubek se tehdy postavil na jejich stranu. Senát, či tehdejší prezident Václav Klaus, naproti tomu zásah kritizovali jako příliš přísný.

Na podporu účastníků akce se konaly různé protestní akce v Praze, v Brně i v Ostravě a na tehdejšího premiéra Jiřího Paroubka dokonce létala vajíčka.

Dlouholetý lídr Pirátů Ivan Bartoš a kandidát koalice Pirátů a STAN na premiéra Ivan Bartoš na tomto CzechTeku byl a v roce 2015 v Lidových novinách na akci zavzpomínal.