Pokud se peníze nevyčerpají, zůstanou na účtu Státního fondu životního prostředí. I příští rok mohou lidé žádat o dotace, až ale bude vyhlášen stejnojmenný program. Ten má do roku 2020 poskytnout dotace v celkové odhadované výši 27 miliard korun.

O Novou zelenou úsporám mohl být podle kritiků větší zájem, kdyby ho na začátku neprovázela nejistota a nezatěžovala administrativa. Prezident Svazu podnikatelů ve stavebnictví v ČR Václav Matyáš poukazuje na to, že nevyčerpané peníze jsou za vrácené žádosti, které nesplňovaly dané podmínky. Kritizovaný je i několikrát oddalovaný termín zahájení příjmu žádostí nebo nedostatek odborníků pro energetický audit.