Čeští a slovenští vojáci spolupracují v mnoha oblastech. V prosinci loňského roku zástupci obou zemí podepsali v Piešťanech dohodu o spolupráci také v zajištění vojenského letového provozu. Dohoda upravuje podmínky zajištění leteckých cvičení, přepravy a plnění úkolů integrovaného systému protivzdušné obrany NATO.

Před deseti lety vznikla iniciativa k vybudování mnohonárodního praporu vojenské policie NATO. Členskými státy jsou Polsko, které je vedoucím státem, ČR, SR a Chorvatsko. V září 2011 se na Slovensku uskutečnilo každoroční cvičení praporu s názvem Black Bear 2011, které je součástí přípravy praporu na certifikaci NATO.

Obě země spolu také vytvořili bojové uskupení EU, které bylo připraveno k nasazení v roce 2009. Podobnou jednotku vytvoří společně s Polskem a Maďarskem v roce 2016.