Na Junckerovu hlavu se v poslední době snesla kritika v souvislosti s britským rozhodnutím vystoupit z Evropské unie. Evropská komise, jíž předsedá, je kritizována i v souvislosti s migrační krizí.

„Jsem svobodný člověk, až budu chtít skončit, skončím a nebudu se nikoho ptát,“ řekl Juncker. Dodal ale, že takový úmysl nemá, zvláště ne pod tlakem kritických hlasů. „A navzdory tomu, že mám velký respekt k práci novinářů, jsem velmi překvapen, že nijak neanalyzovali důvody, proč někdo chce mou demisi a kritizuje Komisi,“ řekl Juncker v rozhovoru.