Podle Zaorálka je celý ústav zpolitizovaný. "Příkladů je víc. Například šest let zpátky, kdy byla volba Dienstbiera staršího, kdy byli osloveni lidé, kteří poté přišli s tím, že spolupracoval s kontrarozvědkou," udává příklad Zaorálek. "O spolupráci ČSSD a komunistů mohu jen spekulovat," říká k tomu senátor Sobotka. "Už bylo řečeno, že archivy, které existují, budou radši dány pod státní archiv," dodává. Největší strach má ODS o složky tajné bezpečnosti, ke kterým má klíč právě ředitel ústavu. Podle Zaorálka jakákoliv manipulace ze strany ČSSD a KSČM nepřichází v úvahu. Podle něj je naopak ODS tím, kdo tahá za nitky.

"Ústav patří vládě a ODS. My jsme tam naopak zvolili lidi, kteří mají vlastní mozek a žádné bratry. A v senátu se budou zodpovídat výroční zprávou, jak ten ústav funguje," říká Zaorálek. "Oni musí zdůvodňovat každý krok," dodává. Na jeho slova ale ostře reaguje Sobotka. "Pokud ale tady pan Zaorálek tvrdí, že ústav patří vládě a ODS, tak lže nám ve studiu a celému národu," dodává. "Zákon byl připravován řadu let. Měli jste šanci a byli jste vyzváni, aby jste k tomu něco řekli" připomíná Sobotka. "Budeme ochotni zákon změnit, ale jen v určitém případě. Pokud ČSSD řekne archivy pryč, tak to bude problém," dodává.