V roce 2003, bezprostředně po Klausově zvolení, jeho tehdejší mluvčí Tomáš Klvaňa prohlásil: „Institut amnestie (prezident) považuje za důležitý a správný, v dané chvíli však nikoliv za adekvátní.“  Sám Klaus v téže době pro Český rozhlas uvedl: „Já si nemyslím, že má prezident opravovat soudní systém. A stejně tak si nemyslím, že bych si měl vytipovat jednu skupinu odsouzených a pokusit se jim dát svobodu na základě toho, že se zmýlili soudci nebo že je chybný trestní zákoník.“