Tisková služba Ministerstva obrany uvedla (http://www.gazeta.ru/army/news/8823017.shtml): „Na základě výsledků prověrky a posouzení na kolegiu, které velí Baltské flotile, ministr obrany odvolal z plnění jejich funkcí náčelníka štábu flotily a další funkcionáře za vážné nedostatky v bojové připravenosti a také za zkreslení zpráv o skutečném stavu věcí.“ 

Na místo viceadmirála Viktora Kravčuka, který flotile velel od roku 2012, Šojgu jmenoval (http://ria.ru/defense_safety/20160630/1455078403.html) 30. června 2016 jako dočasného velitele viceadmirála Alexandra Nosatova, který do nedávna působil v Černomořské flotile Ruska a byl před krátkým časem jmenován velitelem vojenské námořní akademie. 

Média v Rusku předtím spekulovala, že na uvolněný post bude jmenován (http://www.gazeta.ru/army/news/8826389.shtml) bývalý admirál Ukrajiny viceadmirál Sergej Jelisejev, který v době krymské operace v roce 2014 přešel na ruskou stranu. Jelisejev je na Ukrajině stíhán za zradu a působí nyní v ruském baltském námořnictvu. Toto jmenování se ale nepotvrdilo.