Ústav zřídil stát za účelem zkoumání doby nesvobody. Jeden z radních Lukáš Jelínek ČTK řekl, že Ústav je dlouhodobě nestabilní a Rada by se chtěla pokusit o kroky, které by minimalizovaly politický vliv. To, že je ÚSTR zpolitizovaný, si myslí i někteří historici. Potvrzují to rozepře mezi vládnoucími stranami a opozicí. Radu volí Senát, kde má nyní opozice převahu.

Někteří zaměstnanci chtějí dnes veřejně vyjádřit nesouhlas se "současným politickým a ideologickým záměrem ČSSD a KSČM změnit interpretaci totalitní minulosti". "A prostřednictvím Rady Ústavu odvolat současného ředitele, a umožnit tak následně zásadní ideové, strukturální a personální změny ve směrování této instituce," sdělil ČTK odborář Mirek Vodrážka.