Významná část veřejnosti i obě levicové strany s restitucemi pro církve ve vládní podobě nesouhlasí. Názor na tuto problematiku na svém blogu vyjádřil i profesor imunologie a ředitel Ústavu molekulární genetiky Václav Hořejší.

Hořejší ve svém příspěvku zpochybňuje plán na kompletní odluku církve od státu, které chce vláda pomocí restitucí docílit. „Stále více jsem totiž přesvědčen, že současný stav, kdy existuje jasné pouto mezi církvemi a státem, je vlastně lepší – stát platí duchovní (podobně jako třeba učitele) a stará se o údržbu obrovského počtu kostelů(tuto povinnost ovšem stát vykonává, mírně řečeno, neoptimálně),“ píše Hořejší na blogu Aktuálně.cz.

Dodává, že historicko-kulturní význam církví je tak velký, že by stát měl v jejich podpoře pokračovat. Církve by zatím měly i nadále projevovat zájem o udržení kontaktů se státními institucemi. „Nemyslím, že by jim prospělo, kdyby se skutečně dostaly na úroveň onoho pověstného „spolku zahrádkářů“. Jsem přesvědčen, že by z mnoha důvodů bylo dobré, kdyby křesťanství mělo v naší společnosti větší vážnost a vliv než je tomu nyní,“ míní autor blogu. Argument ateistických občanů, kteří nechtějí ze svých daní platit církve, přitom považuje za neplatný, neboť stát podobným způsobem podporuje i jiné obecně prospěšné organizace.