Podle zveřejněné zprávy o kontrole digitalizovaných archiválií ABS patří k nejzávažnějším nedostatkům chybějící části svazků, kopie jsou špatně čitelné, chybí naskenované fotografie. ABS spravuje archivní fondy a sbírky bezpečnostních složek, Komunistické strany Československa a organizací Národní fronty působících v těchto složkách z doby mezi lety 1948 a 1990. Kvůli chybám podle vedení ústavu nyní hrozí, že elektronická verze archivu by mohla podávat zkreslené informace. Naskenovaných stránek je zatím přes 30 milionů.

Čísla o chybovosti jsou ale podle odborů účelová, chybí prý jasný vzorec výpočtu. Seznam kontrolovaných svazků ABS podrobili vlastní analýze a zjistili, že chybovost se pohybuje pod jedním procentem. Podle mluvčího ÚSTR Pavla Ryjáčka je však zjevné, že i odboráři v "digitalizátech" problém spatřují. "Archiv zhruba od února prováděl kontrolu, ve které porovnával originály uložené v archivu s digitalizovanými kopiemi. Našel v tom nesoulad podle hodnocení archivu vážný. Ve zprávě nebylo ani slovo o tom, kdo je viník," reagoval pro ČTK a Český rozhlas. 

Zpráva podle odborů úmyslně obchází závazek ústavu a archivu, že budou společně řešit problémy a podle dvojúrovňové kontroly. Odbor informatiky a digitalizace provádí podle nich kontroly digitalizovaných souborů podle vlastních směrnic, vlastní chybovost se údajně pohybuje hluboce pod jedním procentem, což je lidský faktor. Jsou naopak přesvědčeni, že dostatečná kontrola chybí na straně archivu.