Úřadu má předsedat evropský prokurátor a má mít za úkol vyšetřovat a stíhat trestné činy poškozující rozpočet EU a předvádět pachatele před soudy členských států. Překlene tak prý mezeru mezi trestněprávními systémy členských států, jejichž působnost končí na hranici státu, a subjekty Unie. Jedním z prvních úkolů, kterým by se měla nově zvolená členka Evropské komise Věra Jourová zabývat, je právě návrh na vytvoření úřadu evropského státního zástupce.

Český europoslanec Jan Zahradil vyjádřil svůj postoj těmito slovy: „V tomto případě by vznikl jakýsi zcela nový právní systém nadřazený soudnictví členských států, který by si časem jistě uzurpoval větší a větší pravomoci. Je nesmysl řešit problémy se špatným čerpáním evropských fondů zakládáním nových úřadů. Evropská komise musí v takových případech volat k odpovědnosti úřad, který za kontrolu zodpovídá na národní úrovni. Tento systém funguje dobře a nevidím důvod jej měnit," myslí si Jan Zahradil. A má pravdu.

Dokonce i česká vláda už loni v prosinci zaujala značně rezervovaný postoj, s tím, že nebyly vyjasněny některé základní koncepční otázky a návrh v současné podobě nezaručuje, že by reálně skutečně došlo ke zvýšení účinnosti trestního postihu trestné činnosti spojené s finančními zájmy Evropské unie. Naopak jsou zde důvodné obavy, že by mohlo dojít ke zkomplikování a prodloužení trestního řízení. Česká republika je dále znepokojena také tím, že doposud nebyla věnována dostatečná pozornost ústavním dopadům návrhu na základní práva, například na právo na zákonného soudce či na spravedlivý proces.