Toto rozhodnutí telefonicky avizovala již v pátek 26. 10. 2012 následně zvolenému předsedovi senátorského klubu Petrovi Šilarovi v reakci na zprávu médií o klubové nominaci senátora Jiřího Čunka na post místopředsedy Senátu. Wagnerová Šilarovi vytkla, že nominaci Jiřího Čunka vydával za oficiální stanovisko klubu adresované i zástupcům senátorského klubu ČSSD, ačkoli samotný klub KOD v této věci nehlasoval.

„Toto vyjádření mě znepokojilo, a proto jsem již tehdy avizovala, že bude-li nominace klubem stvrzena, zvážím své setrvání v klubu. Názory Jiřího Čunka na řešení romské problematiky, jakož i jeho praktické kroky v místní politice jsou pro mě nepřekonatelnou překážkou pro akceptaci jeho klubové nominace na senátní místopředsednickou funkci. Nominace totiž rovněž signalizuje i postoj klubu k takovým názorům,“ konstatovala Wagnerová. Odchod z KOD, kde KDU-ČSL disponuje pouze třemi senátory, začala senátorka Wagnerová proto zvažovat již po zasedání klubu dne 31. 10 2012, který nominaci J. Čunka definitivně potvrdil.

„V následujících dnech jsem byla svými voliči a podporovateli seznamována s texty dalšího člena senátorského klubu KOD, Tomia Okamury, které se ideově shodují s názory senátora Jiřího Čunka. Po seznámení se s těmito texty a po důkladném zvážení situace jsem dospěla k názoru, že mé další setrvání v senátorském klubu KOD není možné bez ohrožení důvěryhodnosti programu, s nímž ve volbách získala masivní podporu.“