V rámci PESCO bylo již vedeno 17 společných vojenských projektů. Česká republika avizovala své zapojení do 3 z nich. Mělo by se kupříkladu jednat o projekt s názvem Zjednodušení a sjednocení postupů přeshraničního pohybu vojenských jednotek, který jeho iniciátoři popisují jako tzv. vojenský Schengen, umožňující přesun cizích vojsk napříč evropskými státy.

Komunistická strana Čech a Moravy vytvoření nové vojenské struktury Evropské unie PESCO odsoudila a společně s dalšími evropskými komunistickými a dělnickými stranami vydala prohlášení, ve kterém se mimo jiné konstatuje: „Imperialistické Německo vede členské státy Evropské unie, účastnící se vytvoření nové aktu agresivního zbrojení PESCO. Německá ministryně obrany Ursula von der Leyen v této souvislosti potvrdila, že společné ozbrojené síly jsou základní ideou Evropské unie. Do té doby se nám přitom snažili prezentovat evropskou integraci jako mírový projekt.“