Kontrola Ministerstva dopravy, vycházející z velmi přísných schvalovacích kritérií EU, zjistila pochybení ve dvou zadávacích řízeních, kde vytkla především použití diskriminačních kritérií pro ověření vhodnosti a výběr účastníků, a tím zkrácení uznatelných nákladů o 25 %. Krácení evropské dotace se netýká již schválené částky ve výši 7,4 mld. Kč, kterou DPP při splnění všech pravidel EU vyčerpá.

V tomto případě se jednalo se o dvě zadávací řízení: