Ministerstvem stanovená cena podle zveřejněné kalkulace nepočítá s 15% DPH, předpis však zároveň neuvádí, že by byl výkon od daně osvobozen. V případě, že zájemce potřebuje i lékařské potvrzení o negativním výsledku testu, připlatí si ještě dalších 300 Kč. Od 16. května tak bude konečná cena 2319 korun včetně DPH.

Přestože nová cena nereflektuje plnou výši reálných nákladů na provádění PCR vyšetření pro samoplátce, bude NPK v poskytování služby pokračovat. Aktuální přípis MZČR stanovuje cenu tohoto vyšetření na 1756 korun bez DPH. Vyšetření totiž nemá léčebný cíl, a tak by k němu mělo být připočteno ještě 15% DPH. Citované opatření zároveň neuvádí, že by měla být platba od daně osvobozena. Odběrová místa NPK v Pardubicích a v Litomyšli tak budou znovu testovat i samoplátce, nicméně ministerstvem deklarovanou cenu vyšetření zvýší právě o sazbu DPH, tj. na 2019 Kč.