"Celé to bylo poněkud nestandardní," uvedl po svém odvolání pro MF Dnes Petr Žaluda. Členové představenstva se prý ani nesměli zúčastnit jednání dozorčí rady a byli nuceni opustit místnost. "Nesdělili mi ani žádné výhrady k fungování drah," dodal odvolaný ředitel.

Žaluda stanul v čele Českých drah v únoru 2008. Do funkce jej uvedl ministr Aleš Řebíček, Žaludovi se podařilo uhájit post i za všech jeho nástupců. Za ministra Petra Bendla se jej vehementně pokoušel odstranit právě současný ministr Zdeněk Žák, tehdy v pozici náměstka. Žaluda však tenkrát svůj post udržel.

Během své funkce byl často předmětem kritiky, ať už za kvalitu služeb, které železniční gigant poskytoval, nebo za výši svých odměn. Na jméno mu nemohli přijít ani Radim Jančura a Leoš Novotný, provozovatelé konkurenčních železničních dopravních firem.