Dvě miliardy korun jsou určeny na plánování a zajišťování péče o zvláště chráněná území a území soustavy Natura 2000. Budovat se z nich bude například návštěvnická infrastruktura a rybí přechody, likvidovat invazní druhy rostlin a živočichů a revitalizovat vodní toky a nivy. Zprostředkovatelem těchto dotací bude Agentura ochrany přírody a krajiny ČR.

V příštích pěti letech bude moct Česko využít z evropských fondů na zlepšení životního prostředí celkem zhruba 72 miliard korun (2,6 mld. eur). Měly by například pomoci napojit tisíce domácností na čističky odpadních vod, zvýšit kapacity pro recyklaci odpadů nebo přispět k dalšímu snížení emisí skleníkových plynů.