Probíhající audit Ministerstva financí, který prověřuje čerpání peněz z Evropské unie u dvou desítek českých nemocnic, způsobil názorovou roztržku ve vládní koalici. Ministr zdravotnictví Svatopluk Němeček (ČSSD) zpochybňuje transparentnost auditu, ministr financí Andrej Babiš odkazuje na Evropskou komisi a obviňuje sociální demokracii z předvolebního boje. Do mediální přestřelky byl nakonec nucen vstoupit i premiér Bohuslav Sobotka, který si po skončení auditu hodlá oba ministry pozvat a celou věc urovnat.

Někdejší mluvčí ministra zdravotnictví Julínka Tomáš Cikrt následně v Interview ČT24 vyjádřil přesvědčení, že tak velký problém, za jaký je celá věc vydávána, to není. Nicméně má obavy, zda se zdravotnictví nestává kolbištěm politického boje. Podle něj nejde ani tak o předvolební boj jako o celkovou moc ve státě a kontrolu nad penězi ve zdravotnictví. Dojem boje o moc v něm způsobuje zejména to, že pochybení bylo nalezeno u všech prověřovaných nemocnic, a také probíhající mediální invaze Ministerstva financí.